Vergleichende Genom- und Transkriptomanalysen zum Nachweis chromosomaler Rekombinationen und kleiner RNAs im Penicillin-Produzenten \(\textit {Penicillium chrysogenum}\)
Comparative genomics and transcriptomics uncovers chromosomal recombination and small RNA diversity in the penicillin producing fungus \(\textit {Pencillium chrysogenum}\)
- Das bipolare heterothallische Fortpflanzungssystem des filamentösen Ascomyzeten und Penicillin-Produzenten \(\textit {Penicillium chrysogenum}\) ermöglicht es sexuelle Nachkommen zu generieren. Zum Nachweis von Rekombinationsereignissen, zwischen der DNA beider Kreuzungspartner, wurden die Genome der Parentalstämme und Nachkommen sequenziert. Mit Hilfe vergleichender Genomanalysen konnten genomweite Rekombinationen als Folge der sexuellen Fortpflanzung nachgewiesen werden. In einem zweiten Ansatz konnten, durch Sequenzierungen kleiner RNAs, erstmals Dicer-abhängige kleine RNAs endogener Herkunft in \(\textit {P. chrysogenum}\) nachgewiesen werden. Es konnten endogene \(\textit{small interfering}\) RNAs (siRNAs) und microRNA-ähnliche RNAs (milRNAs) identifiziert werden, die an einem post-transkriptionellen Mechanismus zur Genstilllegung beteiligt sind. Kreuzungen und regulatorisch wirksame kleine RNAs können als Werkzeug zur Manipulation von \(\textit {P. chrysogenum}\) und zur Optimierung industrieller Produktionsstämme verwendet werden.
Author: | Tim Alexander DahlmannORCiDGND |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:294-45782 |
Referee: | Ulrich KückORCiDGND, Franz NarberhausORCiDGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | German |
Date of Publication (online): | 2016/02/09 |
Date of first Publication: | 2016/02/09 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
Date of final exam: | 2015/06/03 |
Creating Corporation: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
Tag: | Genanalyse; Geschlechtliche Fortpflanzung |
GND-Keyword: | Penicillium chrysogenum; Fortpflanzung; Rekombination; Posttranskriptionelle Genregulation; RNS-Interferenz |
Institutes/Facilities: | Lehrstuhl für Allgemeine und Molekulare Botanik |
Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie |
faculties: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |