Plastidäres RNA \(\it trans\)-Spleißen bei der Grünalge \(\textit {Chlamydomonas reinhardtii}\)
- Der \(\it trans\)-Spleißprozess des \(\it psaA\)-Gens aus \(\textit {C. reinhardtii}\) ist ein gut untersuchtes Beispiel für die Prozessierung eines diskontinuierlichen Gruppe II-Intron. Daran sind eine Reihe von Proteinfaktoren beteiligt, wie beispielsweise der Spleißfaktor Raa4. Durch ein Hefe-Zwei-Hybrid-Screening konnte Rab1 als Interaktionspartners identifiziert werden. Durch Sequenzierungen konnte das \(\it RAB1\)-Gen vollständig annotiert und das Protein durch Fluoreszenzmikroskopie im Chloroplasten von \(\textit {C.reinhardtii}\) lokalisiert werden. Für die Analyse der Bindeeigenschaften wurde \(\it RAB1\) heterolog in \(\textit {E.coli}\) exprimiert und das Protein aufgereinigt. Mittels Gelretentionsanalysen konnte eine spezifische Bindung an die \(\it tscA\)-RNA festgestellt werden. Die Wechselwirkung von \(\it Rab1\) mit Raa4, Raa3, Rat2 und Raa1 konnte durch Interaktionsstudien gezeigt werden. Mit der Durchführung von quantitativen Real-Time PCR-Analysen konnte eine verringerte Transkriptmenge von \(\it RAB1\) und \(\it RAT2\) in der Raa4-Mutante festgestellt werden.
Author: | Vera KockGND |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:294-36272 |
Subtitle (German): | molekulargenetische und biochemische Analyse von RNA-Bindeproteinen |
Subtitle (English): | molecular genetic and biochemical analysis of RNA-binding proteins |
Title Additional (English): | Plastid RNA \(\it trans\)-splicing in the green alga \(\textit {Chlamydomonas reinhardtii}\) |
Referee: | Ulrich KückORCiDGND, Franz NarberhausORCiDGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | German |
Date of Publication (online): | 2013/01/22 |
Date of first Publication: | 2013/01/22 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
Date of final exam: | 2012/12/17 |
Creating Corporation: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
GND-Keyword: | Chlamydomonas reinhardtii; RNS-Spleißen; Spleißfaktor; RNS-Bindungsproteine; Intron |
Institutes/Facilities: | Lehrstuhl für Allgemeine und Molekulare Botanik |
Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie |
faculties: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |