Substrate diversity and recognition of the FtsH protease in \(\textit {Escherichia coli}\)
Substratvielfalt und -erkennung der Protease FtsH in \(\textit {Escherichia coli}\)
- Regulierte Proteolyse zur Anpassung des Proteoms an verändernde Umweltbedingungen wird in \(\textit {Escherichia coli}\) unter anderem von der essentiellen und membranverankerten Protease FtsH durchgeführt. Obwohl FtsH unerlässlich für den Organismus ist, sind nur wenige Substrate und Substraterkennungsprinzipien bekannt. Im Rahmen dieser Arbeit wurden mit Hilfe einer inaktiven FtsH-Variante bislang unbekannte Substrate gebunden, mit FtsH co-gereinigt und durch Massenspektrometrie identifiziert. Zwei dieser neu identifizierten Substrate (IscS und DadA) werden konstitutiv degradiert. Differenziell werden hingegen die Proteine FdoH (wuchsphasen- und sauerstoffabhängig) und YfgM (wuchsphasenabhängig und bei osmotischem Stress) abgebaut. Eine Charakterisierung des Membranproteins YfgM indizierte, dass YfgM bei der Regulation von verschiedenen Stressantworten involviert ist. Dazu wurde durch gerichtete Mutagenese eine Erkennungssequenz für FtsH am cytosolischen N-Terminus von YfgM identifiziert.
Author: | Kai Westphal |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:294-38142 |
Referee: | Franz NarberhausORCiDGND, Carsten KöttingORCiDGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | English |
Date of Publication (online): | 2013/07/18 |
Date of first Publication: | 2013/07/18 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
Date of final exam: | 2013/04/23 |
Creating Corporation: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
GND-Keyword: | Proteolyse; Proteasen; Stressreaktion; Anaerobiose; Phosphorylierung |
Institutes/Facilities: | Lehrstuhl für Biologie der Mikroorganismen |
Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |