Plastidäres RNA \(\it trans\)-Spleißen bei der Grünalge \(\textit {Chlamydomonas reinhardtii}\)

  • Der \(\it trans\)-Spleißprozess des \(\it psaA\)-Gens aus \(\textit {C. reinhardtii}\) ist ein gut untersuchtes Beispiel für die Prozessierung eines diskontinuierlichen Gruppe II-Intron. Daran sind eine Reihe von Proteinfaktoren beteiligt, wie beispielsweise der Spleißfaktor Raa4. Durch ein Hefe-Zwei-Hybrid-Screening konnte Rab1 als Interaktionspartners identifiziert werden. Durch Sequenzierungen konnte das \(\it RAB1\)-Gen vollständig annotiert und das Protein durch Fluoreszenzmikroskopie im Chloroplasten von \(\textit {C.reinhardtii}\) lokalisiert werden. Für die Analyse der Bindeeigenschaften wurde \(\it RAB1\) heterolog in \(\textit {E.coli}\) exprimiert und das Protein aufgereinigt. Mittels Gelretentionsanalysen konnte eine spezifische Bindung an die \(\it tscA\)-RNA festgestellt werden. Die Wechselwirkung von \(\it Rab1\) mit Raa4, Raa3, Rat2 und Raa1 konnte durch Interaktionsstudien gezeigt werden. Mit der Durchführung von quantitativen Real-Time PCR-Analysen konnte eine verringerte Transkriptmenge von \(\it RAB1\) und \(\it RAT2\) in der Raa4-Mutante festgestellt werden.

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Metadaten
Author:Vera KockGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-36272
Subtitle (German):molekulargenetische und biochemische Analyse von RNA-Bindeproteinen
Subtitle (English):molecular genetic and biochemical analysis of RNA-binding proteins
Title Additional (English):Plastid RNA \(\it trans\)-splicing in the green alga \(\textit {Chlamydomonas reinhardtii}\)
Referee:Ulrich KückORCiDGND, Franz NarberhausORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:German
Date of Publication (online):2013/01/22
Date of first Publication:2013/01/22
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Biologie und Biotechnologie
Date of final exam:2012/12/17
Creating Corporation:Fakultät für Biologie und Biotechnologie
GND-Keyword:Chlamydomonas reinhardtii; RNS-Spleißen; Spleißfaktor; RNS-Bindungsproteine; Intron
Institutes/Facilities:Lehrstuhl für Allgemeine und Molekulare Botanik
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie
faculties:Fakultät für Biologie und Biotechnologie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht