Charakterisierung des humanen Guanylat-bindenden Proteins 1 mit Hilfe von dynamischer Lichtstreuung und Deuteriumaustausch

  • In dieser Arbeit wurde die Komplexbildung von hGBP1 bei der Hydrolyse von GTP mit Dynamischer Lichtstreuung und Deuteriumaustausch untersucht. Dabei wurden berechnete hydrodynamische Radien aus modellierten Kristallstrukturen mit denen aus den Messungen verglichen, um so die Struktur des Komplexes zu ermitteln. Mit GppNHP (ein nicht hydrolysierbares GTP-Analogon) ergab sich ein über die G-Domänen assoziierender Dimer-Komplex und mit \(GDP/AlF_{x}\) (ein nicht hydrolysierbares GTP-Übergangszustands-Analogon) ein über die Subdomäne \(\alpha\)12/13 gebildeter Tetramer-Komplex. Im zweiten Teil wurden hGBP1 und seine Komplexe an der Oberfläche deuteriert und dann deren Peptide mit Maldi-TOF untersucht. Durch veränderte Deuterierungsgerade, die durch Berechnungen ergänzt wurden, konnten Strukturänderungen nachgewiesen werden. Unter anderem wurde gezeigt, dass bei der Hydrolyse die Subdomäne \(\alpha\)12/13 herausklappt und so das Teramer gebildet wird.

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Metadaten
Author:Maik-Borris LüdemannGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-30673
Referee:Christian HerrmannORCiDGND, Hermann WeingärtnerGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:German
Date of Publication (online):2011/02/22
Date of first Publication:2011/02/22
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2010/12/23
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
GND-Keyword:Dynamische Lichtstreuung; Deuterium / Austausch; Oligomerisation; Hydrodynamik / Radius
Institutes/Facilities:Lehrstuhl für Physikalische Chemie I, Arbeitsgruppe Proteininteraktionen
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht