Charakterisierung des humanen Guanylat-bindenden Proteins 1 mit Hilfe von dynamischer Lichtstreuung und Deuteriumaustausch
- In dieser Arbeit wurde die Komplexbildung von hGBP1 bei der Hydrolyse von GTP mit Dynamischer Lichtstreuung und Deuteriumaustausch untersucht. Dabei wurden berechnete hydrodynamische Radien aus modellierten Kristallstrukturen mit denen aus den Messungen verglichen, um so die Struktur des Komplexes zu ermitteln. Mit GppNHP (ein nicht hydrolysierbares GTP-Analogon) ergab sich ein über die G-Domänen assoziierender Dimer-Komplex und mit \(GDP/AlF_{x}\) (ein nicht hydrolysierbares GTP-Übergangszustands-Analogon) ein über die Subdomäne \(\alpha\)12/13 gebildeter Tetramer-Komplex. Im zweiten Teil wurden hGBP1 und seine Komplexe an der Oberfläche deuteriert und dann deren Peptide mit Maldi-TOF untersucht. Durch veränderte Deuterierungsgerade, die durch Berechnungen ergänzt wurden, konnten Strukturänderungen nachgewiesen werden. Unter anderem wurde gezeigt, dass bei der Hydrolyse die Subdomäne \(\alpha\)12/13 herausklappt und so das Teramer gebildet wird.
Author: | Maik-Borris LüdemannGND |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:294-30673 |
Referee: | Christian HerrmannORCiDGND, Hermann WeingärtnerGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | German |
Date of Publication (online): | 2011/02/22 |
Date of first Publication: | 2011/02/22 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie |
Date of final exam: | 2010/12/23 |
Creating Corporation: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
GND-Keyword: | Dynamische Lichtstreuung; Deuterium / Austausch; Oligomerisation; Hydrodynamik / Radius |
Institutes/Facilities: | Lehrstuhl für Physikalische Chemie I, Arbeitsgruppe Proteininteraktionen |
Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie |
faculties: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |