Replikationsexperimente an offenen Systemen

  • Die EDC-aktivierte Oligomerisierung der offenen, beidseitig ligationsfähigen 5'-Amino-3'-Phosphat-Derivate der vier möglichen Pyrimidin-Purin-deoxynucleotiddimere \(^{H_{2}N}TA^{{PO_{4}}^{2-}}\), \(^{H_{2}N}TG^{{PO_{4}}^{2-}}\), \(^{H_{2}N}CA^{{PO_{4}}^{2-}}\), \(^{H_{2}N}CG^{{PO_{4}}^{2-}}\) wurde untersucht. Eduktkonzentrationen unterhalb 20 mM Dimer zeigten maßgeblich Cyclisierung, höhere Konzentrationen Oligomerisierung. Die beobachtete hohe Reaktivität des CG-Systems wurde auf Slidomere, hochmolekulare Aggregate verschobener Oligomerduplexe, zurückgeführt. Thermodynamische Abschätzungen nach dem Nearest-Neighbour-Modell und Kinetiken mit Templatzugabe unterstützten die Slidomertheorie. Durch das slidomerbedingte und für enzymfreie Kondensationen hohe Oligomerisierungspotenzial konnten innerhalb von 200 min Oligomere mit mehr als 80 Nucleotiden generiert werden. Aufgrund seiner Fähigkeit im Rahmen des Slidomereffektes kollektiv autokatalytisch zu wirken, kann das oligomerisierende CG-System als einfaches "autocatalytic set" nach \(\it Kauffman\) angesehen werden.

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Metadaten
Author:Oliver Thoennessen
URN:urn:nbn:de:hbz:294-8505
Subtitle (German):Oligomerisierung von 5'-Amino-3'-phosphat-Oligodeoxynucleotidderivaten mit alternierenden Pyrimidin-Purin-Sequenzen
Referee:Günter von KiedrowskiGND, Martin FeigelGND, Michael HollmannORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:German
Date of Publication (online):2003/09/23
Date of first Publication:2003/09/23
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2003/07/23
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
GND-Keyword:Oligodesoxynucleotide; Selbstreplikation; Autokatalyse; chemische Evolution; HPLC
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht