Theoretical vibrational spectroscopy of protonated water networks

  • Diese Arbeit behandelt grundlegende Aspekte der theoretischen Schwingungsspektroskopie. Ein neuer Algorithmus wird vorgestellt, um effektive Normalmoden aus ab initio Molekulardynamik Simulationen zu konstruieren, die eine direkte Interpretation von Infrarot Banden in berechneten Absoptionsspektren im Sinne atomarer Bewegung ermöglichen. Diese Analysemethode wird sowohl auf microsolvatisierte Hydronium- und Zundel-Wassercluster in der Gasphase, als auch auf funktionale Wassermoleküle im Bacteriorhodopsin angewandt. Für die Gasphasen-Cluster werden Änderungen individueller Schwingungsmoden, die bei Solvatation mit molekularem Wasserstoff auftreten, untersucht. Für das Zundel Kation führt dies zu einer neuen Interpretation experimenteller Spektren als eine Überlagerung verschiedener Zustände. Im Bacteriorhodopsin Grundzustand können spektrale Signaturen der Wassermoleküle des komplexen Gegenions identifiziert und zugewiesen werden.

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Metadaten
Author:Marcel Dominik BaerGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-29774
Subtitle (English):in the gas phase and bacteriorhodopsin
Referee:Dominik MarxGND, Christof HättigGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2010/11/26
Date of first Publication:2010/11/26
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2010/10/15
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
GND-Keyword:Theoretische Chemie; Ab-initio-Rechnung; Molekulardynamik; Schwingungsspektroskopie; Bacteriorhodopsin
Institutes/Facilities:Lehrstuhl für Theoretische Chemie
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht