Small molecule modulation of protein-protein interactions
- Diese Dissertation untersucht mittels computergestützter Methoden das Potential kleiner Moleküle Protein-Protein-Interaktionen (PPI) und Proteinkonformationen zu beeinflussen. In dieser Dissertation wird der Einfluss einer molekularen Pinzette (CLR01) auf \(\beta\)-Amyloid (A\(\beta\)42), Huntingtin, das menschliche Insel-Amyloid-Polypeptid (IAPP) sowie die PPI 14-3-3\(\zeta\), untersucht. Zu diesem Zweck werden Molekulardynamik Simulationen (MD), Quantenmechanik/Molekülmechanik (QM/MM) Berechnungen und freie Energie Simulationen eingesetzt. Die Ergebnisse dieser Dissertation gewähren Einblicke in die Einschlusskomplexe von CLR01 mit Lysin- und Arginingruppen verschiedener Proteine und bestätigen die Rolle von CLR01 als mögliches Mittel gegen Krankheiten, die mit diesen Proteinen assoziiert werden. Gewonnene Informationen über die Struktur von ME118 können für die weitere Entwicklung von Molekülen genutzt werden, die die Dimerisierung verschiedener 14-3-3 Isoformen beeinflussen.
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| Author: | Sumit MittalGND |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:hbz:294-52640 |
| Subtitle (German): | a computational study |
| Referee: | Elsa Sanchez-GarciaORCiDGND, Simon EbbinghausORCiDGND |
| Document Type: | Doctoral Thesis |
| Language: | English |
| Date of Publication (online): | 2017/05/30 |
| Date of first Publication: | 2017/05/30 |
| Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
| Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie |
| Date of final exam: | 2017/05/05 |
| Creating Corporation: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
| Tag: | Alzheimer-Krankheit |
| GND-Keyword: | Protein-Protein-Wechselwirkung; Amyloid (beta-); Molekulardynamik; Kraftfeld-Rechnung; Huntington-Chorea |
| Institutes/Facilities: | Max-Planck-Institut für Kohlenforschung, Mülheim an der Ruhr / Abteilung für Theoretische Chemie |
| Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie |
| faculties: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
| Licence (German): |  Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |
