Structural and spectroscopic characterization of the catalytic domain of human membrane type 1 matrix metalloproteinase

  • In this thesis one member of this family, the membrane type 1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP or MMP-14) is examined. Four general approaches were employed to better understand the enzymatic activity of MT1-MMP. These are described in the chapters 2 to 5, each representing a self-contained study. These range from detailed structural analysis of the active site of the protein using Xray crystallography, to new assays for enzymatic activity where substrate delivery to the protein is tightly controlled. In the final two chapters three new spectroscopic approaches for studying the catalysis of MT1-MMP are described. The first of these is high pressure spectroscopy which allows solvation, energetics and volume changes to be study in detail.
  • In dieser Arbeit wird ein Mitglied dieser Proteinfamilie, die Typ 1 Membran Metalloproteinase (MT1-MMP oder MMP-14) untersucht. Dazu wurden vier Herangehensweisen entwickelt, um die enzymatische Aktivität von MT1-MMP besser verstehen zu können. Die Bandbreite der Methoden erstreckt sich von detaillierten Strukturanalysen des aktiven Zentrums mit Hilfe von Röntgen Kristallstrukturanalyse, bis hin zu Untersuchungen der enzymatischen Aktivität bei der die Substrataufnahme des Proteins im Detail untersucht wurde. In den letzten beiden Kapiteln werden abschließend drei neue spektroskopische Herangehensweisen zur Untersuchung der katalytischen Aktivität von MT1-MMP beschrieben. Bei der ersten dieser Methoden handelt es sich um Hochdruckspektroskopie gekoppelt mit einer externen Störung (z. B. durch Temperatur), die es erlaubt das Verständnis, welches dem katalytischen Mechanismus der Metalloproteasen im Bezug auf Löslichkeitsverhalten, Energie- und Volumenänderungen zugrunde liegt besser zu verstehen.

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Metadaten
Author:Elena DecanetoGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-53041
Subtitle (English):catalytic mechanism, stability and inhibition
Referee:Martina HavenithORCiDGND, Wolfgang LubitzORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2017/07/10
Date of first Publication:2017/07/10
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2016/04/29
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
GND-Keyword:Metalloproteinasen; Kristallstruktur; Spektroskopie; Katalytische Aktivität; Enzymaktivität
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht