Charakterisierung des HPV-Typenspektrums bei HIV-positiven Männern mittels Next Generation Sequencing
- In dieser Dissertation wird die Pyrosequenzierung von Roche (454-Sequenzierung), die zu den "next-generation sequencing"-Technologien gehört, für den HPV-Nachweis optimiert. Dabei werden Analabstriche HIV-positiver Männer untersucht. Die DNA wird durch eine Nested PCR mit Consensus-Primern amplifiziert. Multiplex Identifiers (MIDs) ermöglichen es, zehn Proben gleichzeitig zu sequenzieren. Eine große Anzahl multipler HPV-Infektionen konnte nachgewiesen werden, Reproduzierbarkeit, Sensitivität und Spezifität waren eingeschränkt. Die NGS-Technologien ermöglichen es, Proben auf viele HPV-Typen gleichzeitig zu untersuchen und weisen v.a. multiple Infektionen nach. Die Optimierung der Methode war ressourcenintensiv. Die durch die PCR bedingte Verzerrung der Typisierungsergebnisse führt dazu, dass nur ein Ausschnitt des tatsächlich vorhandenen Typenspektrums dargestellt wird.
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| Author: | Kristin Enrica WellbrockGND |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:hbz:294-53495 |
| Referee: | Klaus Thomas ÜberlaGND, Norbert BrockmeyerORCiDGND |
| Document Type: | Doctoral Thesis |
| Language: | German |
| Date of Publication (online): | 2017/07/26 |
| Date of first Publication: | 2017/07/26 |
| Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
| Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Medizinische Fakultät |
| Date of final exam: | 2017/05/02 |
| Creating Corporation: | Medizinische Fakultät |
| Tag: | Sequenzanalyse (Chemie) |
| GND-Keyword: | Humanes Papillomavirus; HIV; DNA-typing; Virusinfektion; Polymerase-Kettenreaktion |
| Dewey Decimal Classification: | Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / Medizin, Gesundheit |
| Licence (German): |  Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |
