Charakterisierung der Wegenersche Granulomatose assoziierten Region auf Chromosom 6p21.3 mittels \(\it {tagSNP}\)-basierter Feintypisierung

  • A genomic region on chromosome 6p21.3 (including \(\textit {HLA-DPB1}\)) has been shown to comprise predisposing factors for Wegener's Granulomatosis (WG). Because of the complex structure of this region it is unclear, whether a certain \(\textit {HLA-DPB1}\) allele \(\textit {(HLA-DPB1*0401)}\) itself and/or another factor linked to this allele make this locus a genomic region predisposing to WG. To narrow down the causative molecular genetic variation(s), a detailed genetic map of this genomic region has been created by genotyping of \(\textit {tagging single nucleotide polymorphisms (SNPs)}\) and \(\textit {HLA-DPB1}\) in 282 WG patients and 380 healthy controls. The strong association of WG with the \(\textit {HLA-DPB1*0401}\) allele was confirmed in ANCA\(^{+}\) patients. Further association signals partly independent from ANCA\(^{+}\) were found as well. These results definitely highlight the impact of this genomic region in the pathogenesis of WG and make it a \(\textit {quantitative trait locus}\) for WG.
  • Die Prädisposition zur Wegenerschen Granulomatose (WG) ist in hohem Maße mit einer genomischen Region auf Chromosom 6p21.3 (enthält u.a. das \(\textit {HLA-DPB1}\) Gen) assoziiert worden. Aufgrund der komplexen Struktur dieser Region ist es unklar, ob ein spezielles \(\textit {HLA-DPB1}\) Allel (*0401) und/oder ein anderer, gekoppelter Faktor diesen Lokus zu einer genomischen Risikoregion machen. Um die ursächliche(n) molekulargenetische(n) Variation(en) eingrenzen zu können, wurde bei 282 WG Patienten und 380 gesunden Kontrollen anhand der Genotypisierung von \(\textit {tagging single nucleotide polymorphisms (SNPs)}\) und \(\textit {HLA-DPB1}\) eine detaillierte genetische Karte der Region erstellt. Die starke Assoziation von WG mit dem \(\textit {HLA-DPB1*0401}\) Allel konnte für ANCA\(^{+}\) Patienten bestätigt werden. Desweiteren konnten von \(\textit {HLA-DPB1}\) teilweise unabhängige Assoziationen mit WG nachgewiesen werden. Diese Ergebnisse unterstreichen somit die Bedeutung der untersuchten Region in WG und charakterisieren sie als \(\textit {quantitative trait locus}\).

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Metadaten
Author:Michael HeckmannGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-27667
Referee:Jörg T. EpplenORCiDGND, Bianca MiterskiGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2010/03/01
Date of first Publication:2010/03/01
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Medizinische Fakultät
Date of final exam:2010/01/21
Creating Corporation:Medizinische Fakultät
GND-Keyword:Vasculitis; Prädisposition; SNP; Allel; Genotypisierung
Institutes/Facilities:Medizinische Fakultät, Abteilung für Humangenetik
Dewey Decimal Classification:Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / Medizin, Gesundheit
faculties:Medizinische Fakultät
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht