Identifizierung einer neuen Funktion der 7SK RNA als Regulator der Genexpression

  • In dieser Arbeit wurde die Interaktion einer sn RNA mit dem p20.1-Protein untersucht. Es wurde der direkte Nachweis erbracht, dass die Wechselwirkung in intakten Zellen vorliegt. Auf Seite des Proteins wurde die RNA-Bindungsdomäne durch gezielte Mutationen eingegrenzt. Durch 2D-NMR-Analysen konnte auf Seite der sn RNA dann eine berechnete Sekundärstruktur der an der Wechselwirkung beteiligten Subdomäne verifiziert werden. Das RNA-Aptamer wurde im Kontext einer höchst aktiv transkribierten, viralen RNA in intakten Zellen überexprimiert. Anschließend wurden Transkriptomanalysen mit Microarray-Chips durchgeführt, in welchen signifikante Unterschiede im Vergleich zu Kontrollzellen beobachtet werden konnten, die mit den Effekten bei einem siRNA-induzierten Knockdown des Proteins übereinstimmten. Diese Ergebnisse legen eine Regualtion der p20.1-kontrollierten zellulären Prozesse durch die sn RNA nahe.

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Metadaten
Author:Sebastian EilebrechtGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-28260
Referee:Bernd-Joachim BeneckeGND, Christian HerrmannORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:German
Date of Publication (online):2010/06/28
Date of first Publication:2010/06/28
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2008/12/08
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
GND-Keyword:RNS-Polymerase II; Small nuclear RNA; RNS-Polymerase III; RNS-Bindungsproteine; Genexpression
Institutes/Facilities:Lehrstuhl für Biochemie I
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht