Identifizierung einer neuen Funktion der 7SK RNA als Regulator der Genexpression
- In dieser Arbeit wurde die Interaktion einer sn RNA mit dem p20.1-Protein untersucht. Es wurde der direkte Nachweis erbracht, dass die Wechselwirkung in intakten Zellen vorliegt. Auf Seite des Proteins wurde die RNA-Bindungsdomäne durch gezielte Mutationen eingegrenzt. Durch 2D-NMR-Analysen konnte auf Seite der sn RNA dann eine berechnete Sekundärstruktur der an der Wechselwirkung beteiligten Subdomäne verifiziert werden. Das RNA-Aptamer wurde im Kontext einer höchst aktiv transkribierten, viralen RNA in intakten Zellen überexprimiert. Anschließend wurden Transkriptomanalysen mit Microarray-Chips durchgeführt, in welchen signifikante Unterschiede im Vergleich zu Kontrollzellen beobachtet werden konnten, die mit den Effekten bei einem siRNA-induzierten Knockdown des Proteins übereinstimmten. Diese Ergebnisse legen eine Regualtion der p20.1-kontrollierten zellulären Prozesse durch die sn RNA nahe.
Author: | Sebastian EilebrechtGND |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:294-28260 |
Referee: | Bernd-Joachim BeneckeGND, Christian HerrmannORCiDGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | German |
Date of Publication (online): | 2010/06/28 |
Date of first Publication: | 2010/06/28 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie |
Date of final exam: | 2008/12/08 |
Creating Corporation: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
GND-Keyword: | RNS-Polymerase II; Small nuclear RNA; RNS-Polymerase III; RNS-Bindungsproteine; Genexpression |
Institutes/Facilities: | Lehrstuhl für Biochemie I |
Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie |
faculties: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |