Terahertz spectroscopy of proteins

  • Zur Beschreibung der dynamischen Hydratation von Biomolekülen wurden Terahertz (THz) Solvatationsstudien im Gleichgewicht und an Reaktionen in Echtzeit durchgeführt. Für Letzteres wurde ein kinetisches THz Absorptions-(KITA) Spektrometer entwickelt und angewendet. Im chemischen Gleichgewicht wurde das Einsetzen von Wassernetzwerkdynamiken an Modellpeptiden unterhalb einer Monolagenbedeckung aus \(\approx 02248\); 20 H\(_{2}O\) beobachtet. Für das Protein \(\it {Ubiquitin}\) wurde eine dynamische Hydrathülle von > 18 Å ermittelt, die > 1000 H\(_{2}\)O umfasst. Im Nichtgleichgewicht wurden Wassernetzwerkdynamiken bei der Faltung des Proteins \(\it {Ubiquitin}\) und bei der Enzymkatalyse durch \(\textit {MT1-MMP}\) mit KITA Spektroskopie zeitaufgelöst untersucht. In Kombination mit komplementären Methoden und Simulationen wurde gezeigt, dass Wassernetzwerkdynamiken mit der frühen Biostrukturierung während der Proteinfaltung gekoppelt sind, ebenso wie mit der spezifischen molekularen Erkennung und dem Einsetzen des Substratumsatzes bei der Enzymkatalyse.

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Metadaten
Author:Benjamin Philipp BornORCiDGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-28663
Subtitle (English):hydration dynamics of proteins during folding, enzyme catalysis and in chemical equilibrium
Referee:Martina HavenithORCiDGND, Christian HerrmannORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2010/07/22
Date of first Publication:2010/07/22
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2010/06/01
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
GND-Keyword:Hochfrequenzspektroskopie; Hydratation; Biomolekül; Solvatation; Absorptionsspektrometer
Institutes/Facilities:Lehrstuhl für Physikalische Chemie II
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht