Small regulatory RNAs in \(\textit {Agrobacterium tumefaciens}\)

Kleine regulatorische RNAs in \(\textit {Agrobacterium tumefaciens}\)

  • \(\textit {Agrobacterium tumefaciens}\) ist ein Pflanzen-pathogenes Bakterium. Überwiegende Teile dieser Arbeit befaßten sich damit kleine regulatorische RNAs (sRNAs) in diesem Organismus zu identifizieren und zu charakterisieren. Eine bioinformatische Vorhersage für sRNAs sowie Hochdurchsatz-cDNA-Sequenzierungen (RNA-seq) lieferten zahlreiche Kandidaten. Die sRNA AbcR1 verhindert die Translation von \(\it atu2422\) und induziert die Degradation der mRNA. Das \(\it atu2422\)-Gen kodiert ein \(\gamma\)-Aminobuttersäure (GABA)-bindendes Protein. GABA ist am Abwehrmechanismus der Pflanze beteiligt. Eine Virulenz-induzierte sRNA sowie einige sRNAs, die auf dem Gegenstrang von Virulenz-Genen gefunden wurden, deuten auf einen Einfluss auf die Virulenz-Kaskade von \(\it Agrobacterium\) hin. Ein drittes Teil-Projekt war dem RNA-Chaperon Hfq gewidmet. Eine \(\it hfq\) Deletions-Mutante wies eine erhöhte Expression von ABC-Transportern, sowie signifikante Defizite im Wachstum, der Zell-Morphologie, der Motilität und der Tumor-Bildung auf.

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Metadaten
Author:Ina Wilms
URN:urn:nbn:de:hbz:294-32435
Referee:Franz NarberhausORCiDGND, Danja SchünemannGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2011/11/08
Date of first Publication:2011/11/08
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Biologie und Biotechnologie
Date of final exam:2011/07/01
Creating Corporation:Fakultät für Biologie und Biotechnologie
GND-Keyword:Agrobacterium tumefaciens; Small RNA; Aminobuttersäure (gamma-); Genexpression; Ribosomale Bindungsstelle
Institutes/Facilities:Lehrstuhl für Biologie der Mikroorganismen
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht