Understanding hydration \(\it via\) solvent thermodynamics and vibrational signatures
- In dieser Dissertationsschrift haben wir unser Verständnis der Hydratation gelöster Moleküle durch die detaillierte Analyse der Dynamik und Thermodynamik des Lösungsmittels vertieft. Zu diesem Zweck, haben wir MD Simulationen solvatisierter Ionen, Edelgas-Atome, kleinen Molekülen, und von Enzymen wie der MT1-MMP und der künstlich entwickelten Kemp-Eliminasen, analysiert. Unsere Analysemethoden erlauben es die Schwingungsfreiheitsgrade von Wassermolekülen im THz Frequenzbereich, die Entropie von Hydratwasser-Molekülen, und lokale potentielle Energiebeiträge durch Wechselwirkungen zwischen dem gelösten Molekül und dem umgebenden Lösungsmittel, sowie durch Interaktionen zwischen den Lösungsmittel-Molekülen, mit hoher räumlicher Auflösung zu berechnen. Unsere Ergebnisse heben die heterogenen Eigenschaften der Hydrathülle von Proteinen hervor, welche von Variationen der lokalen Krümmung der Protein-Oberfläche und die grosse Anzahl unterschiedlicher funktioneller Gruppen verursacht wird.
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| Author: | Viren PattniORCiDGND |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:hbz:294-56668 |
| Referee: | Matthias HeydenGND, Lars V. SchäferORCiDGND |
| Document Type: | Doctoral Thesis |
| Language: | English |
| Date of Publication (online): | 2018/04/16 |
| Date of first Publication: | 2018/04/16 |
| Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
| Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie |
| Date of final exam: | 2018/03/06 |
| Creating Corporation: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
| GND-Keyword: | Simulation; Kraftfeld; Hydratation; Lösungsmittel; Proteine |
| Institutes/Facilities: | Max-Planck-Institut für Kohlenforschung, Mülheim an der Ruhr / Abteilung für Theoretische Chemie |
| Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie |
| faculties: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
| Licence (German): |  Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |
