Ein Konformationswechsel als Determinante der CO\(_{2}\)/O\(_{2}\)-Spezifität von Rubisco
- Rubisco ist das zentrale Enzym des Calvinzyklus photoautotropher Organismen. Es katalysiert sowohl die biomasseakkumulierende Carboxylierungs- als auch die verschwenderische Oxygenierungsreaktion. Das Verhältnis der katalytischen Effizienzen von Carboxylierung und Oxygenierung ist der Spezifitätsfaktor. Diese Kennzahl variiert beträchtlich zwischen verschiedenen Organismen. Die Zeitfensterhypothese propagiert einen enzyminaktivierenden Strukturübergang des C-terminalen Stranges als Determinante der Spezifität. Neu entwickelte Sequenzanalysemethoden zeigten einen deutlichen Einfluß C-terminaler Residuen auf die Spezifität und führten so zur Konzeption spezifitätsverbesserter Mutanten. Ein Konformationswechsel des C-terminalen Elements wurde in Molekulardynamiksimulationen beobachtet und energetisch charakterisiert. Der Effekt dieses schalterartigen Strukturübergangs auf katalytisch essentielle Residuen konnte mittels statistischer Methoden nachgewiesen werden.
Author: | Christian BurischGND |
---|---|
URN: | urn:nbn:de:hbz:294-16756 |
Referee: | Jürgen SchlitterGND, Walter OettmeierGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | German |
Date of Publication (online): | 2006/07/25 |
Date of first Publication: | 2006/07/25 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
Date of final exam: | 2006/06/22 |
Creating Corporation: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
GND-Keyword: | Carboxylierung; Oxygenierung; Sequenzanalyse (Chemie); Molekulardynamik; Freie Energie |
Institutes/Facilities: | Lehrstuhl für Biophysik |
Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie |
faculties: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |